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學校積極支持嶗山實驗室建設，協同打造國家戰略科技力量。主持建設我國地球科學領域首個教育部前沿科學中心（深海圈層與地球系統前沿科學中心），主持海洋領域首個國家自然科學基金委基礎科學中心項目（多場多體多尺度耦合及其對海工裝備性能與安全的影響機制）。建有全國重點實驗室、國家工程技術研究中心、國家地方聯合工程研究中心、教育部重點實驗室、農業部重點實驗室等省部級以上各類科研基地平臺40余個。

擁有科學考察實習船舶3艘，包括5000噸級新型深遠海綜合科考實習船“東方紅3”、3000噸級海洋綜合科學考察實習船“東方紅2”、300噸級的“天使1”科考交通補給船，形成了自近岸、近海至深遠海并輻射到極地的海上綜合流動實驗室系統，具備了一流的海上現場觀測能力。